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行政院長陳建仁於地震後隔天前往災區視察，並下達各部會「從優、從速、從簡」三原則，盡全力協助地方政府救災及重建。除了組成包括工程會、主計總處、經濟部、交通部、內政部、農業部、教育部、環境部、原民會、文化部、衛福部、勞動部、金管會、財政部等在內的專案小組外，也特別指示內政部主導成立「危老重建輔導團及花蓮重建辦公室」，就近、就地貼心協助受災民眾，提供全方位支持。
這次的行政院「0403震災復原重建方案」，經費來源包括中央特種基金、前瞻、疫後特別預算、中央特別統籌分配稅款、中央災準金、中央二備金、地方災準金及賑災基金會民間善款。其中，公共設施搶修及重建184.4億、民房災損安置及重建58.4億、產業振興40.8億、其他保險補助及就業協助方案1.9億，合計總經費需求約285.5億元。
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其中，在花蓮縣賴以維生的觀光產業振興措施方面，交通部觀光署推出「旅宿業融資信用保證」「自由行住宿優惠」「團體旅遊補助」「Taiwan PASS-台鐵通用版」「台灣好行及觀巴擴大營運協助」「鼓勵境外包機旅客赴花蓮旅遊」「拍攝花蓮美麗安心旅遊宣傳影片及推廣」「適時加開觀光列車」等，8項方案，投入經費逾13億元。
旅宿業融資信用保證部分，將協助旅宿業順利取得資本性融資或周轉金的貸款。旅宿業可自受災日起1年內向承貸金融機構申請資本性融資及週轉金貸款；其中資本性融資部分，旅館每家最高3000萬、民宿最高400萬；周轉金部分，旅館每家最高1000萬、民宿最高300萬。
旅客自由行住宿優惠方面，交通部祭出補助住宿花蓮及台東合法旅宿，花蓮週一至週四入住每房補助1000元，週五至週日入住每房補助500元；台東週一至週四入住每房補助1000元。
團體旅遊補助措施方面，旅行業辦理2天1夜以上旅遊團（放假日不超過1日），且每團20人以上，入住花蓮最高補助2萬、入住台東最高補助1.5萬；每家旅行社最多申請5團。
另外，交通部也整合台鐵包裝國內外旅客適用的「Taiwan PASS-台鐵通用版」，推出2人同行1人免費優惠。另外，預計自6月1日起，台灣好行花東路線免費搭乘，台灣觀巴花東地區2折優惠。
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交通部也把振興觀光的目標放到國外，推出方案鼓勵境外包機旅客赴花蓮旅遊的包機費用，搭載50名外籍旅客可請領獎助外，也會依不同市場提供30萬、35萬跟40萬的補貼獎助額度，帶動花東地區旅遊觀光產業發展。另外，也會針對國際行銷再進行規劃，預計下半年推出。
交通部觀光署長周永暉指出，花東自由行旅宿補助方案與團體補助方案，預計7月1日上路，限期3個月，目的無非是要在短期內快速讓花蓮的產業復甦；他強調，「這次的方案比0206地震時還更優惠」。
另外，原民會也特別針對部落旅遊提出3000萬經費，提振過去頗負盛名的部落體驗行程；另外，文化部也透過文化幣加碼的方式來挹注，預計經費2000萬；農業部也特別規劃獎勵農業旅遊的相關方案，經費約1.83億。上述加總後，陸續將推出一波又一波的振興觀光措施，總經費將來到15.84億。
天災難以預防，尤其是地震更是台灣人自小到大的共同回憶；這次花蓮近海發生的規模7.2地震，更是自921大地震之後最大的一次。受到重創的花蓮縣災情目前已穩定，現在最重要的就是如何恢復往日生活，這次中央部會快速推出了震災復原與振興產業的方案，相關補助更甚以往，後續就有賴國人的「贊助」，一起讓寶島台灣的美麗後山恢復往昔光輝。
